Faculty - دانشکده کشاورزی

Faculty - دانشکده کشاورزی

P.H.D dissertations

بررسي in silicoمتابوليسم ترپنوئيد ها با نگرش بر مسير بيوسنتز تاكسول
سارا فرح بخش 2018
گياهان با توليد متابوليتهاي ثانويه، منبع بزرگي از عوامل موثر دارويي را ايجاد مينمايند. تاكسول )پاكليتاكسول( يك متابوليت ثانويه مهم در درخت سرخدار است، كه عنوان يك تركيب دارويي بسيار موثر در درمان طيف وسيعي از سرطانها كاربرد دارد. به دليل كمياب بودن منابع توليد تاكسول، هزينۀ توليد اين ماده بسيار بالا است. بهينه سازي ژنهاي دخيل در مسير بيوسنتز تاكسول، يكي از بهترين راهها براي افزايش توليد تاكسول ميباشد. در اين راستا، شناسايي دقيق ژنها و 01 – دي (TS) ضروري ميباشد و مطالعات تكاملي مي توانند اطلاعات فراواني در اين زمينه فراهم آورند. تاكسادين سنتاز دو ژن مهم در مسير بيوسنتز تاكسول هستند. در مطالعۀ حاضر، (DBAT) استيل ترانسفراز O -01β -III استيلباكاتين الگوي تكاملي واگرايي توالي در اين دو ژن مورد تجزيه و تحليل قرار گرفت. در بررسيهاي فيلوژنتيك مشخص شد كه با تبارنماي گونه سازگار نيستد، و در هردو ژن، اشتراك آللها در بين گونهها و DBAT و TS تبارنماي مرتبط با ژنهاي به طور DBAT و TS جايگزيني موازي اسيدهايآمينه مشاهده شد. بررسي اثر انتخاب طبيعي مشخص نمود كه هر دو ژن كلي تحت تاثير انتخاب طبيعي منفي قرار دارند، اما با استفاده از مدلهاي حداكثر احتمال، تاثير انتخاب طبيعي مثبت در ميتواند نشاندهندۀ عملكرد TS برخي ازجايگاههاي اسيدآمينه مشخص شد. وجود اين جايگاهها در ناحيۀ انتهاي آميني مهم اين ناحيه باشد. آنزيم ژرانيل ژرانيل دي فسفات سنتاز يكي ديگر از آنزيمهاي مهم در مسير بيوسنتز تاكسول ميباشد. اين آنزيم يك پيش مادۀ مهم براي توليد بسياري از ترپنوئيدها است. در تحقيق حاضر با شناسايي هومولوگ هاي خانوادۀ ژرانيلژرانيل ديفسفات سنتاز، روند تكاملي اين خانواده با استفاده از آناليزهاي فيلوژنتيك مورد مطالعه قرارگرفت. همچنين، الگوي فرايندهاي مضاعف شدن و از دست دادن ژن در طي تكامل گياهان، با استفاده ازمعيار بهينه سازي مبتني بر پارسيموني بررسي شد. نتايج مشخص نمود كه خانوادۀ ژرانيلژرانيل ديفسفات سنتاز يك خانوادۀ در حال گسترش است. اغلب اين فرايندهاي گسترش در اثر پديدۀ مضاعف شدن كل ژنوم ايجاد شده اند. با اين وجود، فرايندهاي تكثير تكراري ژن ها در پديده هايي كه منجر به گسترش در يك تبار خاص شده است، بيشتر به وقوع پيوسته است. همچنين بررسي تنوع جايابي پروتئين در داخل سلول و بررسي الگوي بياني ژنها مشخص نمود كه فر
Thesis summary
بررسي بيان ژن TpGAS در مسير بيوسنتزي پارتنوليد و تاثير پارتنوليد بر روي لاين هاي سلولي مختلف
نسا جعفري 2017
براساس يافته هاي باليني، بيش از 60% بيماران مبتلا به سرطان از گياهان به عنوان مكمل در درمان خود استفاده مي كنند. گياه بابونه كبير، Tanacetum parthenium به دليل وجود تركيب موثره مهمي به نام پارتنوليد داراي خاصيت ضدسرطاني است. در مطالعه حاضر، اثر ضدسرطاني پارتنوليد خالص شده از بابونه كبير بر روي لاين هاي سلولي سرطان سينه بررسي شد. پارتنوليد با استفاده از دو تكنيك كروماتوگرافي ستوني و HPLC preparative خالص شد. ميزان مهاركنندگي آن بر روي سلول هاي سرطاني سينه با تكنيك MTT مطالعه گرديد. نحوه القاي مرگ سلولي از طريق ميكروسكوپ الكترني نگاره، آناليز سيكل سلولي و تست Annexin بررسي شد. بيان ژن Caspase 8 در مسير خارجي آپاپتوز و p21، p53، bid، puma،Bax و Bim از ژن هاي دخيل در سرطان و مسير داخلي آپاپتوز به صورت كمي توسط Real-time RT-PCR مورد سنجش قرار گرفت. پروتئين هاي تغيير يافته تحت اثر تيمار پارتنوليد با استفاده از روش الكتروفورز دوبعدي و تكنيك MALDI-TOF شناسايي شد. در اين مطالعه براي اولين بار تاثير پارتنوليد بر روي ژن Bim و پروتئين هاي مهمي چون وايمنتين و فاكتور طويل سازي الفا-1 مطالعه شد. بارگذاري پارتنوليد بر روي نانوذرات سيليكا عامل دارشده باعث افزايش آبدوستي اين تركيب شده وليكن خاصيت ضدسرطاني آن را كاهش داد. بررسي بيان دو ژن كليدي مسير بيوسنتز پارتنوليد به نام هاي TpGAS و TpPTS در 4 بافت گل، ساقه، برگ و ريشه مويين گياه بابونه كبير انجام شد. اين دو ژن در بافت گل داراي بيشترين بيان بوده كه با الگوي استخراج پارتنوليد مطابقت دارد. با توجه به نتايج اين مطالعه پارتنوليد علاوه بر القاي آپاپتوز، منجر به توقف تهاجم و متاستاز در سلول-هاي سرطاني مي شود. بنابراين استفاده از آن به عنوان دارو يا مكمل دارويي در درمان سرطان پيشنهاد مي گردد
Thesis summary

Master Theses

بررسي توليد بيوسرفكتانت در محيط كشت ميكروارگانيسم هاي تجزيه كننده نفت
فائزه غلامي 2023
چكيده: آلودگي نفتي يك مشكل جدي در محيط زيست است و مي تواند تأثيرات زيان باري بر اكوسيستم هاي طبيعي، سلامت جوامع انساني، زيست جانوران و جوانه زني و رشد گياهان داشته باشد. روش هاي مختلفي براي حذف آلودگي نفتي در آب، خاك و هوا وجود دارد. امروزه، روش هاي زيستي (ميكروارگانيسم زيست پالا) با توليد متابوليت هايي مانند بيوسرفكتانت ها، توانايي حذف تركيبات آلوده كننده محيطي را دارند. سرفكتانت ها، با كاهش كشش سطحي بين آب و هيدروكربن ها و تشكيل ميكروامولسيون، هيدروكربن هاي نامحلول را در خود حل مي كنند. اهميت اين تركيبات را در مقايسه با سرفكتانت هاي سنتزي مي توان در عدم سميت، سازگاري با محيط زيست، فعاليت در محدوده وسيعي از دما و pH برشمرد. در اين پژوهش توانايي توليد بيوسرفكتانت توسط هشت ميكروارگانيسم زيست پالا، با استفاده از روش گسترش نفت، هموليز خون، فروپاشي قطره و فعاليت امولسيون كنندگي، در محيط كشت نوترينت براث، در سه غلظت نفت و سه زمان مختلف بررسي گرديد. جهت بررسي آن بر گياه، از محلول بيوسرفكتانت ميكروارگانيسم هاي منتخب در روش هاي غربال گري، بر جوانه زني بذر گياه گندم در دو غلظت نفت، استفاده گرديد. نتايج نشان داد باكتري انتروباكتر كلواكه (B19) توانايي هموليز خون را پس از 24 ساعت داشت. ميكروارگانيسم هاي انتروباكتر (B5)، سودوموناس (B7)، كانديدا (B9) و انتروباكتر كلواكه (B19) توانايي برهم زدن لايه نفتي در سطح آب و فروپاشي قطره را داشته و فعاليت امولسيون كنندگي قابل توجهي در مقايسه با SDS (كنترل مثبت) داشتند. به نظر مي رسد طبق نتايج اين تحقيق بيوسرفكتانت توليد شده توسط باكتري انتروباكتر (B5) رامنوليپيد باشد. محلول بيوسرفكتانت ميكروارگانيسم هاي مورد بررسي، بر جوانه زني بذر گندم، مانع از جوانه زني بذور نشدند و تفاوت معني داري بين تيمارها مشاهده نشد. نتايج نشان داد كه بيوسرفكتانت، توسط برخي از ميكروارگانيسم هاي زيست پالاي اين تحقيق، توليد مي شود و بيوسرفكتانت هاي توليد شده ويژگي هاي متفاوتي از نظر ساختار يا ويژگي هموليزي داشتند. همچنين بيوسرفكتانت توليد شده توسط اين ميكروارگانيسم ها اثر منفي بر رشد گياه گندم نداشتند.
Thesis summary
بررسي خواص سايتوتوكسيك عصاره باكتري سودوموناس آئروژينوزا بر برخي باكتري هاي پاتوژن و بذور علف هاي هرز
زينب كرد 2023
چكيده: مشكلاتي در استفاده از عوامل سايتوتوكسيك مانند علف كش ها يا آنتي بيوتيك ها بر عليه ميكروارگانيسم هاي بيماري زا (گياهي و انساني) وجود دارد. به طور مثال با ايجاد مقاومت باكتري ها به آنتي بيوتيك ها، تأثيرگذاري اين تركيبات كاهش مي يابد. استفاده از علف كش هاي صنعتي نيز مي تواند اثرات جبران ناپذير بر محيط زيست بگذارد. مطالعات نشان داده است كه برخي از ميكروارگانيسم ها، توانايي توليد تركيبات متنوع با خواص ضد ميكروبي عليه پاتوژن ها و همچنين خاصيت علف كشي دارند. سودوموناس آئروژينوزا، تركيباتي مانند رنگ دانه توليد مي كند كه خواص سايتوتوكسيك دارند. در اين پژوهش سه سويه باكتري سودوموناس آئروژينوزا (سودوموناس آئروژينوزا ATCC27853 و دو سويه سودوموناس بيمارستاني)، جهت بررسي توليد رنگ دانه انتخاب شدند. شناسايي مولكولي با استفاده از پرايمرهاي 16sDNA انجام شد. اثر تيمارهاي مختلف محيط كشت، دما و pH، بر توليد رنگ دانه توسط سه سويه باكتري سودوموناس آئروژينوزا بررسي گرديد. اثر عصاره رنگي باكتري هاي سودوموناس آئروژينوزا بر كنترل جوانه زني بذور علف هاي هرز بابونه، تاج خروس و ترشك و همچنين خواص ضد باكتريايي آن، جهت ممانعت از رشد چند باكتري پاتوژن انساني و گياهي، بررسي شد. طبق نتايج همرديفي در پايگاه NCBI و رسم درخت خويشاوندي، توالي هر دو سويه سودوموناس آئروژينوزا با كد دستيابي OR617081و OR623762 در اين پايگاه ثبت گرديد. بيشترين ميزان توليد رنگ توسط سويه ها در محيط هاي مايع كينگ ب و پپتون، pH خنثي و دماي 36 درجه سلسيوس حاصل شد. عصاره رنگي خالص هر سه سويه باعث ممانعت كامل از جوانه زني بذر ترشك شد. عصاره رنگي هر سه سويه باعث كاهش قابل توجه جوانه زني بذر بابونه و ممانعت كامل از جوانه زني بذر تاج خروس شد. در بررسي خواص ضد ميكروبي، بيش ترين ميزان ممانعت از رشد براي ميكروارگانيسم بيماري زاي گياهي پكتوباكتريوم آتروسپتيكوم (B3)، توسط عصاره رنگي باكتري سودوموناس آئروژينوزا (H2)، مشاهده گرديد. نتايج اين تحقيق نشان داد كه عصاره رنگي سويه هاي سودوموناس آئروژينوزا داراي ويژگي هاي مختلف سايتوتوكسيك بوده و مي توان به عنوان يك كانديد علف كش و آنتي بيوتيك مورد مطالعه و استفاده قرار گيرد.
Thesis summary
بررسي آنزيم هاي تجزيه كننده لاكاز، سلولاز، پكتيناز و پروتئاز در باكتري هاي تجزيه كننده نفت و توانايي همزيستي آن ها با گياه گندم
2023
چكيده: نفت خام به عنوان يكي از منابع اصلي انرژي در جهان محسوب مي شود و آلودگي خاك توسط نفت يكي از مشكلات جدي و شايع است. در دنيا سالانه حدود شش ميليون تن نفت خام وارد محيط زيست مي شود. نفت خام حاوي تركيبات هيدروكربني و فلزات سنگين است كه مي-تواند بر خواص بيولوژيكي، شيميايي و فيزيكي خاك تأثير منفي داشته باشد. ورود اين تركيبات به طبيعت به علت سمي بودن، ايجاد جهش و سرطان زائي براي موجودات زنده و همچنين پايداري بالا و انباشته شدن آن ها باعث اختلال در عملكرد طبيعي خاك از جمله عملكرد محصولات كشاورزي و تغيير در ويژگي هاي خاك مي گردد. روش هاي مكانيكي و شيميايي كه جهت حذف آلودگي هاي نفتي از خاك به كار مي روند كارايي محدود داشته و پر هزينه مي باشند. ولي با استفاده از ميكروارگانيسم ها مي توان تركيبات نفتي را به آب و كربن دي اكسيد (شرايط هوازي) و يا متان (شرايط بي هوازي) تبديل نمود و از خاك خارج كرد. زيست پالايي تركيبات نفتي در محيط هاي آلوده موثرتر و از نظر اقتصادي به صرفه تر از روش هاي ديگر مي باشد. مطالعات نشان داده است كه باكتري ها شاخص ترين عوامل تجزيه هيدروكربن ها در محيط هستند، آلودگي محيط زيست توسط اين ميكروارگانيسم كاهش مي يابد. ظرفيت بالاي آنزيمي به ميكروارگانيسم ها اين اجازه را مي دهد كه هيدروكربن هاي پيچيده را تجزيه كنند. هدف از اين مطالعه، بررسي اثرات ميكروارگانيسم هاي تجزيه كننده نفت بر رشد گياه گندم تحت تنشِ حضور غلظت هاي مختلف نفت سفيد (صفر و 3 درصد) مي باشد. اين ميكروارگانيسم ها شامل 4 سويه باكتري و يك مخمر بودند. براي اين منظور آزمايشي در قالب طرح بلوك كاملاً تصادفي با سه تكرار در سال 1401 در آزمايشگاه بيوتكنولوژي دانشكده كشاورزي دانشگاه بوعلي سينا اجرا گرديد. در اين پژوهش خاك آلوده به نفت توسط ميكروارگانيسم هاي تجزيه كننده نفت تلقيح شد. پس از گذشت 30 روز گياهان از سطح خاك برداشت و برخي ويژگي هاي فيزيولوژي و شاخص هاي بيوشيميايي گياهان اندازه گيري شد. نتايج تجزيه واريانس نشان داد اثر نوع باكتري بر شاخص هاي درصد جوانه زني، طول ريشه، وزن تر ريشه، وزن تر ساقه، وزن خشك ساقه، وزن خشك ريشه، كلروفيل a، فنل، فلاونوئيد، آنتي اكسيدان، قند كل ، پروتئين معني دار شد و براي طول ساقه، كلروفيل b و كاروتنوئيد معني دار نشد. كاهش رشد گياه در اثر سميت نفت سفيد در گياه مشاهده شد. ه
Thesis summary
اثر باكتري هاي تجزيه كننده نفت بر رشد گياه كنجد در خاك آلوده به نفت
الهام فيضي 2023
يكي از عمده‎ترين و شايع ترين مشكلات كشاورزي تنش‎هاي غير زيستي مي باشد. از مهمترين اين تنش ها آلودگي‎هاي نفتي و مشتقات آن يعني هيدروكربن‎هاي نفتي مي باشد كه به دليل نشت نفت در حين اكتشاف، توليد، حمل و نقل و ذخيره سازي آن‎ها رخ مي دهد. روش‎ها و فناوري‎هاي متعددي براي پاكسازي زمين‎هاي كشاورزي آلوده به نفت بكار برده مي شود كه اغلب پرهزينه هستند و نفت و مشتقات آن را به طور ناقص تجزيه مي‎كنند. از مقرون به صرفه‎ترين و سريع‎ترين روش‎هاي تجزيه آلاينده هاي نفتي، تجزيه زيستي با كمك ميكروارگانيسم هاي تجزيه كننده نفت و مشتقات آن است. در اين پژوهش، 5 ميكروارگانيسم به روش مولكولي با استخراج DNA و توالي يابي ژن 16S RNAو ژن ITS شناسايي شدند. توالي آن‎ها در پايگاه اطلاعاتي NCBI ثبت شد و تنوع ژنتيكي و درخت فيلوژنتيكي آن ها با استفاده از نرم افزار مگا نسخه7 رسم گرديد. اين ميكروارگانيسم ها شامل چهار سويه باكتري (Methylorubrum sp. ، Rhodococcus sp.، Pseudomonadota bacterium، Enterobacter sp.) و يك مخمر(Candida sp.) بودند. ميزان رشد و تجزيه مواد نفتي توسط اين ميكروارگانيسم ها در غلظت هاي مختلف نفت سفيد (2 ، 5 ، 10 ، 20 ، 30 و 50 درصد) مورد بررسي قرار گرفت. اين ميكروارگانيسم ها در تمامي غلظت ها رشد كردند كه بيشترين ميزان رشد مربوط به ميكروارگانيسم هاي Pseudomonadota bacterium و Enterobacter sp. وكمترين نيز مربوط به ميكروارگانيسم Methylorubrum sp.بود. ميكروارگانيسم Candida spنيز رشد متوسطي داشت. با توجه به اهميت گياه زراعي كنجد و حساس بودن اين گياه به نفت و مشتقات آن، به منظور بررسي خواص فيزيكوشيميايي اين گياه در حضور ميكروارگانيسم هاي بدست آمده و غلظت هاي مختلف نفت سفيد (2، 5، 20، 30 و 50 درصد) مجموع آزمايشاتي در 5 تكرار به صورت طرح كاملا تصادفي در قالب فاكتوريل انجام شد. نتايج تجزيه واريانس نشان داد كه برهمكنش باكتري و نفت سفيد براي وزن تر ريشه، وزن خشك ريشه، طول ريشه، وزن خشك ساقه و طول ساقه، كلروفيل a، b، كل و كاروتنوئيد، فنل كل، فلاونوئيد كل و ظرفيت آنتي اكسيداني معني دار نشد. اما اين برهمكنش براي وزن تر ساقه در سطح 1 درصد معني دار شد. مقايسه ميانگين نشان داد كه ميزان وزن تر ريشه كنجد در غلظت 2 درصد معني دار شد و همچنين ميكروارگانيسم هاي Rhodococcus sp، Candida sp باعث افزايش وزن تر ري
Thesis summary
بررسي اثر ميكروارگانيسمهاي تجزيهكننده نفت روي رشد اوليه گياه كلزا در خاك آلوده به نفت سفيد
ليلا رسولي چايباغي 2023
امروزه نفت يكي از ضروري ترين منابع انرژي مي باشد كه آلودگي هيدروكربن هاي آن به يكي از آلودگي هازيست محيطي خطرناك در جهان تبديل شده است. ايران كشور نفت خيزي مي باشد كه سالانه در طي حمل ونقل و تصفيه و ذخيره سازي نفت، مقدار زيادي آلودگي نفتي وارد خاك ها و آب هاي آن مي گردد. آلاينده هاي نفتي براي حفظ وزنده ماني انسان، حيوان، گياه و ميكروارگانيسم ها مضر مي باشد. روش هاي فيزيكي و شيميايي مختلفي براي پاك سازي اين آلاينده ها از محيط وجود دارد؛ اما زيست پالايي روشي ساده تر، كم خطرتر و مقرون به صرفه تر در مقايسه با ساير روش ها مي باشد. امروزه باكتري ها و مخمرها تجزيه كننده نفت مختلفي شناسايي شده اند كه از مهم ترين عوامل زيست پالايي آلاينده هاي نفتي شناخته مي شوند. گياه كلزا به عنوان گياه ارزشمند و اقتصادي مهمي در جهان شناخته شده است كه نسبت به آلاينده هاي نفتي محيط حساس مي باشد. در طي پژوهش حاضر نقش پنج گونه ميكروارگانيسم تجزيه كننده نفت بر روي جوانه زني و رشد گياه كلزا در محيط حاوي دو و پنج درصد نفت بررسي گرديد. دراين پژوهش صفات مورفولوژي مانند طول و وزن اندام هوايي و ريشه، صفات بيوشيميايي مانند رنگ دانه هاي فتوسنتزي، فنل، فلاونوئيد و ظرفيت آنتي اكسيداني همچنين صفات مربوط به جوانه زني يعني درصد جوانه زني، طول اندام هوايي و ريشه، شاخص بلند شدن هيپوكوتيل و ريشه اندازه گيري گرديد. نتايج حاكي از آن بود كه حضور نفت دو و پنج درصد، براي رشد كلزا بسيار سمي بوده و مانع از جوانه زني و رشد گياه شد. حضور ميكروارگانيسم ها در خاك اثر مطلوبي بر اكثر صفات فيزولوژيك گياه كلزا داشته و منجر به افزايش رشد گياه كلزا گرديد. همچنين حضور ميكروارگانيسم ها در خاك آلوده به نفت از اثرات سمي نفت بر رشد گياه جلوگيري كرده و منجر شد گياه توانايي مقابله با آلاينده را تا حدودي پيداكرده و بتواند در شرايط سخت تنش رشد كند و حتي در برخي از صفات عملكردي مانند گياه شاهد(كشت شده درخاك غير آلوده) داشته باشد. نتياج گاز كروماتوگرافي نشان داد ايزوله مينتايج توالي يابي با استفاده از پرايمرهاي نواحي 16Srna و 18sRNA نشان داد سه گونه از اين ميكروارگانيسم ها مربوط به باكتري هايRhodococcus، Luteimonas،Enterobacter و دو گونه مربوط به مخمر Candida هستند.
Thesis summary
مطالعه القاء آندروژنز از طريق كشت بساك در فلفل همداني و فلفل دلمه‎اي (Capsicum annuum)
مهسا مرادي 2022
فلفل به عنوان يكي از اعضاي مهم خانواده ي سولاناسه شناخته مي شود. در اين تحقيق كشت بساك چهار ژنوتيپ هيبريد فلفل دلمه اي، Maxibell، Padron، Westland و Vergasa و چهار ژنوتيپ فلفل غيردلمه اي بومي استان همدان به نام هاي بيور يك، بيوردو، بيور سه و فلفل شمشيري انجام گرفت. دو روش كشت بساك داماس و همكاران و سيبي و همكاران مقايسه شدند. اين دو روش از لحاظ نوع محيط كشت و شرايط باززايي و نگهداري جنين باهم تفاوت داشتند. در هر روش اثر منبع كربن مورد بررسي قرار گرفت. منبع كربن شامل گلوكز( 10، 20و 30 گرم در ليتر) و همچنين ساكارز( 30 گرم در ليتر) بودند كه محيط كشت 30 گرم در ليتر ساكارز به عنوان شاهد انتخاب شد. در روش داماس و همكارن از سه نوع محيط كشت C، R و MS استفاده شد. كه محيط كشت C براي كالوس زايي و محيط كشت R براي باززايي و محيط كشت MS براي رشد گياهچه باززايي شده استفاده شد. در روش سيبي و همكاران از يك محيط دو فازي مايع و جامد استفاده شد. محيط مايع، محيط Nisch and Nisch بدون آگار بود و محيط كشت جامد، محيط كشت Nisch and Nisch حاوي 8 گرم در ليتر آگار و 5 درصد كربن فعال و بدون هورمون بود. ژنوتيپ Vergasa بهترين عملكرد را به طور كل در هر دو روش داشت و اين ژنوتيپ بهترين باززايي گياه را در محيط كشت حاوي 20 گرم در ليتر گلوكز (05/6 درصد)، نشان داد. بهترين باززايي براي فلفل همداني در محيط كشت 30 گرم در ليتر گلوكز مربوط به ژنوتيپ يك (5/4 درصد) و دو (00/4 درصد) بودند. به طور كل روش سيبي و همكاران نتيجه بهتري را نشان داد به طوري كه از 68 گياه باززايي شده 38 عدد آن مربوط به روش سيبي و همكاران بود. درصد گياهان هاپلوئيد باززايي شده در روش داماس و همكاران 40 درصد و در روش سيبي و همكاران 52 درصد بود. همچنين در روش سيبي و همكاران از هورمون استفاده نشد ولي با اين اوصاف نتايج بهتري نسبت به روش داماس و همكاران نشان داد.
Thesis summary
بررسي اثر دما و كلريد سديم بر رنگ توليد شده در كشت باكتري هاي مولد رنگ
فاطمه پيرحياتي 2021
چكيده: رنگ هاي مورد استفاده در صنايع مختلف را مي توان به دو گروه رنگ هاي طبيعي و رنگ هاي مصنوعي تقسيم كرد. رنگدانه هاي طبيعي به عنوان متابوليت ثانويه توسط برخي ميكروارگانيسم ها، گياهان و جانوران توليد مي شوند و به دليل سلامتي در كاربرد آن ها با رنگ هاي سنتزي در حال جايگزيني هستند. توليد رنگدانه از ميكروارگانيسم ها به دلايلي از جمله رشد سريع و آسان ميكروب، سهولت استخراج و تنوع گسترده رنگ، نسبت به ساير منابع زيستي داراي مزاياي بيشتري است. در اين تحقيق اثر عوامل محيطي دما، pH و كلريد سديم بر رنگ توليد شده در كشت باكتري هاي مولد رنگ بررسي شد. نمونه برداري از منابع مختلف خاك و اندام هاي مختلف نمونه هاي گياهي (برگ، ساقه ميوه و ريشه)، جمع آوري شده از استان همدان و برخي استان هاي جنوبي و غربي ايران، انجام شد. نمونه ها در محيط كشت نوترينت آگار كشت داده شدند و باكتري هاي مولد رنگدانه جدا و خالص شدند. توليد رنگ توسط جدايه ها در محيط كشت هاي مايع نوترينت براث، لوريا برتاني براث و پپتون براث بررسي گرديد. اثر دما (هشت، 28 و 40 درجه سلسيوس)، غلظت هاي مختلف كلريد سديم (صفر، 1/0 و يك مول) و pH (2/5، 2/7 و 2/9) بر توليد رنگ در محيط كشت مايع آزمايش شد. ژن rRNA S16 براي شناسايي مولكولي ميكروارگانيسم استفاده شد. اسپكتوروفتومتري جهت تعيين طيف رنگ هاي توليد شده انجام شد. عصاره باكتري توسط GC-MS بررسي گرديد. حضور آنزيم هاي خارج سلولي (آميلاز، پروتئاز و ليپاز) در جدايه ها آزمايش شد. نتايج نشان داد از 48 جدايه داراي كلني رنگي، 10 جدايه در واكشت هاي بعدي توانايي توليد رنگدانه را حفظ كردند. از 10 جدايه، شش جدايه آميلاز مثبت و چهار جدايه پروتئاز مثبت بودند، فعاليت آنزيمي ليپاز مشاهده نشد. اين 10 جدايه كوكسي يا باسيل بوده و داراي كلني-هاي مدور با طيف رنگي از زرد، نارنجي، گلبهي تا قهوه اي بودند. از 48 جدايه، فقط يك جدايه در محيط كشت مايع پپتون توانايي توليد رنگ داشت. مطالعات مولكولي نشان داد كه اين جدايه سودوموناس آئروجينوزا است. اين باكتري در محيط كشت مايع پپتون توليد رنگ قهوه اي مايل به قرمز كرد. در تيمارهاي دمايي رنگ هاي آبي و قهوه اي مايل به قرمز، و در تيمارهاي كلريد سديم رنگ هاي سبز و قهوه اي مايل به قرمز توليد شدند. در تيمارهاي pH تنها رنگ قهوه اي مايل به قرمز مشاهده شد. بنظر مي رسد، تيماره
Thesis summary
بررسي اثر برخي ويژگي هاي بيوشيميايي و pH در تجزيه نفت توسط باكتري هاي زيست پالا
پرستو ارام بن 2021
چكيده: امروزه نفت خام به عنوان يكي از منابع اصلي انرژي محسوب مي گردد. ورود تركيبات نفتي به محيط زيست به صورت مداوم در طي توليد، تصفيه، حمل و نقل و ذخيره سازي، خطر قابل توجهي در اكوسيستم هاي دريايي و زميني ايجاد كرده است. ورود اين تركيبات به طبيعت، به سبب سمي بودن، ايجاد جهش و سرطان زايي براي موجودات زنده و همچنين پايداري زياد و انباشته شدن تدريجي آن ها در خاك باعث اختلال در عملكرد طبيعي خاك از جمله كاهش عملكرد محصولات كشاورزي و تغيير در ويژگي هاي خاك مي گردد. زيست پالايي تركيبات نفتي در محيط هاي آلوده موثرتر، قوي تر و از نظر اقتصادي مقرون به صرفه تر از روش هاي ديگر مي باشد. مطالعات نشان داده است كه باكتري ها شاخص ترين عوامل تجزيه هيدروكربن ها در محيط هستند، هر چند عوامل محيطي مانند pH مي تواند در زنده ماني يا عملكرد آن ها اثر بگذارد. هدف از اين مطالعه، جداسازي باكتري هاي تجزيه كننده نفت خام از منابع مختلف و بررسي اثر pH در رشد آن ها بود. در تابستان و پاييز 1398، نمونه هاي باكتري از منابع مختلف خاك و آب از استان همدان، شهرستان هاي اطراف همدان، استان خوزستان، استان هاي غربي ايران، و همچنين اندام هاي مختلف نمونه هاي گياهي (برگ، ساقه، ميوه و ريشه) جمع آوري گرديد. نمونه ها در محيط حاوي يك دهم درصد نفت سفيد كشت داده شدند. پس از خالص سازي، رشد باكتري در غلظت هاي بالاتر نفت سفيد بررسي شدند. همچنين اثر pH (اسيدي، خنثي و قليايي) در رشد ميكروارگانيسم ها در محيط حاوي يك درصد نفت بررسي گرديد. حضورآنزيم هاي خارج سلولي (ليپاز، آميلاز، پروتئاز و كاتالاز) در اين باكتري ها بررسي شدند. جدايه هاي باكتري از نظر ريخت شناسي بررسي گرديدند. نتايج نشان داد كه از 63 نمونه جدا شده اوليه، 10 جدايه قادر به رشد در محيط حاوي نفت يك درصد به عنوان تنها منبع كربن بودند. در بين pHهاي بررسي شده، pH 7 مناسب تر از pHهاي قليايي و اسيدي براي رشد جدايه ها بود، گرچه در pHهاي قليايي و اسيدي نيز جدايه ها رشد قابل توجهي داشتند. بررسي ميزان رشد جدايه B1 درpH هاي مختلف طي مدت زمان سه روز نيز نشان داد كه در زمان 48 ساعت بيشترين ميزان رشد را داشت و بعد از آن كاهش رشد مشاهده شد . توليد آنزيم هاي خارج سلولي در 10 جدايه باكتري بررسي شد و نتايج نشان داد كه سه جدايه ليپاز مثبت، دو جدايه آميلاز مثبت، يك جدايه پروتئاز مثب
Thesis summary
جدا سازيي وبررسيي برخيي خواص بييوشييمييايييي اندوفييت هايي درختچه گز
مهرانگيز خداويسي 2020
اندوفييت ها مييكروارگانييسم هايييي هستند كه بخشيي ييا تمام چرخه زندگيي خود را درون گيياه زندگيي ميي كنند، بدون ايينكه هييچ گونه آسييب ظاهريي به گيياه وارد كنند. تحقييقات نشان مييدهد كه قارچ هايي اندوفييت منابع بسييار باارزشيي برايي تولييد تركييبات ضد مييكروبيي، تولييد متابولييت هايي گوناگون از قبييل متابولييت هايي ثانوييه و آنزييم ها جهت استفاده در كشاورزيي،صنعت و پزشكيي ميي باشند. در ايين پژوهش نمونه برداريي در پاييييز 97 97 از درختچه هايي سالم گز،از قسمت هايي مختلف بافت گيياه مانند:رييشه ،ساقه ،برگ و طوقه، همچنيين از خاك كنار طوقه صورت گرفت. در مجموع 30 جداييه قارچيي از قسمت هايي مختلف درختچه گز جداسازيي شد وييك باكتريي رنگيي نييز از خاك كنار طوقه بدست آمد. همه جداييه هايي قارچيي به روش مورفولوژييكيي شناسايييي شدند. با استفاده از اتانول، عصاره گييريي از قارچ ها انجام گرفت. سه تست آنزييميي آمييلاز، پروتئاز و سلولاز رويي جداييه هايي قارچيي صورت گرفت. نتاييج نشان داد كه 12 درصد از جداييه هايي قارچيي دارايي فعالييت آمييلاز در محييط PDA و نشاسته آگار بودند. 28 درصد دارايي آنزييم خارج سلوليي پروتئاز و 25 درصد در محييط PDA و سلولوز آگار، دارايي فعالييت آنزييم سلولاز بودند. عصاره سهدو جداييه قارچيي اندوفييتيي خاصييت ضدباكترييايييي در برابر باكترييهايي بييمارييزايي انسانيي داشتند.
Thesis summary
جداسازي و شناسايي مخمرهاي پروبيوتيك از منابع مختلف
محدثه غفاري 2019
ميكروارگانيسم هاي پروبيوتيك با قرار گرفتن در محيط روده ميتوانند تعادل ميكروبي را افزايش دهند تا سودمندي آنها افزايش يابد و از فعاليت ميكروارگانيسمهاي غير مفيد و بيماريزا جلوگيري شود. مخمرها گروهي از پروبيوتيكهاي يوكاريوت هستند كه كمتر از باكتريها مورد مطالعه قرار گرفتند. مخمرهاي پروبيوتيك داراي خصوصيات منحصر به فردي مانند اندازه بزرگتر نسبت به باكتريها، عدم حساسيت به مواد ضدباكتريايي، تحمل شرايط نامطلوب دستگاه گوارش و بيان انواع مختلف پروتئين هاي درماني سازگار با يوكاريوتي هستند. مخمرهاي پروبيوتيك به عنوان يك عامل درماني براي درمان برخي از انواع اختلالات روده، آلرژيها، عدم تحمل لاكتوز، كاهش سطح كلسترول سرم و متعادل كردن فلور روده به طور گسترده استفاده ميشوند. با توجه به اهميت مخمرهاي پروبيوتيك، اولين قدم جداسازي سويههاي مخمري با خصوصيات پروبيوتيك ميباشد. در تحقيق حاضر، نمونهبرداري از منابع مختلف غذايي، حيواني و انساني انجام شد. ويژگيهاي پروبيوتيكي آنها در غلظتهاي مختلف اكسگال ) 3 / 0 ، 5 / 0 و 1 درصد(، نمك NaCl ( 2 ، 4 و 6 درصد(، pH هاي مختلف اسيدي و قليايي ) 2 ، 4 ، 8 / 5 ، 9 و 11 (، دماي بالاي 37 درجه سلسيوس بررسي شدند. سويههاي مخمر از نظر فعاليت آنزيمي از جمله آنزيمهاي آميلاز، پروتئاز، پكتيناز، سلولاز، ليپاز، اوره آز، كاتالاز، سيتراتاز و هموليزين بررسي شدند. خاصيت ضد باكتريايي عليه باكتري هاي بيماري زا اشرشيا كولي، شيگلا سوني، كلبسيلا پنومونيه، پروتئوس ميرابيليس، سالمونلا تيفي موريوم و استافيلوكوكوس اورئوس بررسي شدند. سويههاي مخمر منتخب Clavispora lusitaniae MGK01 جدا شده از كيوي و Meyerozyma guilliermondii MGP02 جدا شده از پرتقال توسط آزمايشهاي ريخت شناسي، بيوشيميايي و مولكولي تاييد شدند و توالي 18s rRNA آنها در بانك ژن ثبت گرديدند.
Thesis summary
جداسازي قارچهاي پني سيليوم توليد كننده رنگ از گياه و خاك
مريم بابايي 2019
پني سيليوم جنسي از رده هيفومايست ها (گروهي از قارچ هاي ناقص) مي باشد. اين قارچ با دارا بودن؟؟ گونه شناخته شده داراي گسترش جهاني در تمام دنيا مي باشد. گونه هاي مختلف پني سيليوم به دليل گستردگي در طبيعت و نقش مهمي كه در زندگي انسان دارند، از اهميت خاصي برخوردارند. اين ميكروارگانيسم ها، توانايي توليد متابوليت هايي با اهميت، مانند آنزيم ها، رنگ ها و همچنين تركيبات آنتي باكتريايي را دارند. هدف از اين مطالعه، جداسازي قارچ هاي پني سيليوم توليد كننده رنگ از منابع مختلف بويژه گياه و خاك بود. در اين پژوهش، 70 نمونه گياهي از اندام هاي مختلف (برگ، ساقه، ميوه و ريشه) از استان هاي ايلام، همدان، البرز و گيلان در فصل پاييز و خاك شهر همدان جمع آوري گرديد. همچنين نمونه برداري قارچ هاي پني سيليوم مولد رنگ از منابع ديگر مانند غذايي و حيواني نيز صورت گرفت. قارچ هاي مولد رنگ در محيط شناسايي شدند. اثر نور (شرايط روشنايي و تاريكي)، منبع كربن (سوكروز و گلوكز)، pH (اسيدي، خنثي و قليايي) و نمك (NaCl، 50 يا 100 ميلي گرم در ليتر) در توليد رنگ بررسي شد. حضورآنزيم هاي خارج سلولي (آميلاز، پروتئاز و سلولاز) بررسي شدند. جدايه قارچي از نظر مورفولوژيكي بررسي گرديدند. شناسايي ملكولي توسط پرايمر بتا-توبولين صورت گرفت. نتايج نشان داد كه از 70 نمونه مورد بررسي، 31 جدايه قارچي پني سيليوم جدا گرديد كه از اين 31 جدايه قارچي، 18 جدايه قارچي پني سيليوم قادر به توليد رنگ در محيط بودند.از 18 جدايه قارچي، پنج نمونه شناسايي گرديدند. توليد آنزيم هاي خارج سلولي در 18 جدايه قارچي بررسي شد و نتايج نشان داد كه چهار پرگنه آميلاز مثبت،12 پرگنه پروتئاز مثبت و 10 پرگنه سلولاز مثبت بودند. بررسي اثر عوامل خارجي درتوليد رنگ نشان داد كه شرائط تاريكي مناسب تر از شرائط روشنايي بود. در بين pHهاي بررسي شده، pH 8/5 براي توليد رنگ مناسب تر بود، دو جدايه توانايي توليد رنگ در pH 9 و 4 را داشتند. منبع كربن در توليد رنگ قارچ اثر گذاشت، بطوري كه دو جدايه در محيط حاوي گلوكز، و سه جدايه در محيط سوكروز رنگ بيشتري توليد كردند. اين قارچها در محيط حاوي 100 ميليگرم در ليتر نمك قادر به توليد رنگ بودند. نتايج بررسي مورفولوژي نشان داد كه از پنج جدايه، چهار جدايه متعلق به جنس تلارومايسس و يك جدايه متعلق به جنس پني سيليوم بودند. بررسي مولكولي در جدا
Thesis summary
جداسازي و بررسي بيوشيميايي اندوفيت هاي گياه فرفيون و سلمه تره
اعظم بخشياني 2018
چكيده اندوفيت هاي گياهي به دلايلي مانند اثر بر رشد گياه و توليد فرآوده هاي مختلف به ويژه فرآوده هايي با خاصيت دارويي، از اهميت بالايي برخوردار هستند. مطالعات نشان داده است كه اندوفيت ها قادر به توليد متابوليت هاي مشابه با ميزبان هستند. اين مطلب مي تواند در توليد متابوليت هاي با ارزش گياهي دستاورد مهمي باشد. قسمت هاي مختلف گياه فرفيون و سلمه تره در تابستان هزار و سيصد و نود و پنج، از دو منطقه در استان همدان جمع آوري شدند. نمونه برداري از شش بافت مختلف؛ گل، برگ، جوانه، ريشه، طوقه و ساقه صورت گرفت. از دو گياه جمع آوري شده، هفده اندوفيت باكتريايي و سي و يك اندوفيت قارچ جداسازي شدند. براي تعدادي از جدايه هاي قارچ شناسايي مورفولوژيك صورت گرفت. آزمايشات بيوشيميايي از قبيل حضور آنزيم هاي خارج سلولي (آميلاز، ليپاز، پروتئاز، سلولاز، پكتيناز، زايلاناز، لاكاز)، حضور كيفي برخي متابوليت هاي ثانويه، توليد كيفي و كمي تاكسول، و تاثير عصاره اندوفيت بر جوانه زني بذر چند گياه بررسي شدند. نتايج نشان داد هفتاد و هفت درصد از جدايه هاي قارچي و شصت و شش درصد از جدايه-هاي باكتريايي داراي آنزيم خارجي پروتئاز، چهل پنج درصد سلولاز و سي و پنج درصد پكتيناز بودند. عصاره اندوفيت ها اثر منفي بر جوانه زني بذور گياهي نشان داد. در برخي از عصاره ي اندوفيت هاي باكتريايي، حضور آلكالوئيد ها و ترپن ها ديده شد. توليد تاكسول در عصاره هشت جدايه از اندوفيت هاي باكتريايي و عصاره ي گياه فرفيون به روش اچ پي ال سي تاييد گرديد. بيشترين مقدار توليد تاكسول در جدايه آده با مقدار بيست و دو ميكروگرم در ميلي ليتر گزارش شد. بررسي هاي مولكولي چهار جدايه باكتري آده، آسي و پنج، ب سيزده و ب پانزده انجام شد.
Thesis summary
جداسازي و بررسي خواص بيوشيميايي و ضد ميكروبي اندوفيت هاي گياه سماق
علي تهذيبي 2018
چكيده: سماق گياهي دارويي است، كه خواص دارويي، ضد ميكروبي و آنتي اكسيداني آن به اثبات رسيده است. اندوفيت ها ميكروارگانيسم هايي هستند كه درون بافت هاي گياهي بدون ايجاد آسيب ظاهري به گياه، زندگي مي كنند. اين ميكروارگانيسم ها، توانايي توليد متابوليت هاي با اهميت، مانند آنزيم ها و رنگ ها و همچنين تركيبات آنتي باكتريال را دارند. اهداف اين مطالعه، جداسازي قارچ هاي اندوفيت گياه سماق و بررسي تركيبات بيوشيميايي و خواص ضد ميكروبي آنها مي باشد. در اين پژوهش سماق از ارتفاعات و مناطق پوششي شهر سركان، واقع در شهرستان تويسركان در فصل تابستان جمع آوري گرديد. از اندام هاي مختلف سماق، نمونه برداري انجام شد و قارچ هاي اندوفيت آن جداسازي گرديد. توليد آنزيم هاي خارج سلولي به صورت كيفي بررسي شد. توليد رنگ و اثر pH و غلظت هاي مختلف نمك بر روي توليد آن بررسي گرديد. حضور تركيبات آنتي باكتريال در كشت هفت باكتري بيماري زاي انساني و گياهي بررسي شد و همچنين حضور متابوليت هاي ثانويه در محيط كشت قارچ نيز مورد بررسي قرار گرفت. 44 جدايه از قسمت هاي مختلف گياه سماق جداسازي شدند و از نظر مورفولوژيكي بررسي گرديدند. همچنين سه جدايه با استفاده از پرايمر هاي ITS از نظر مولكولي شناسايي شدند. بيشتر اين قارچ ها توانايي توليد آنزيم هاي پروتئاز، كاتالاز و سلولاز را دارا بودند. توليد رنگ در محيط كشت يازده جدايه قارچي مشاهده شد كه تغييرات pH و غلظت نمك بر ميزان رنگ توليدي موثر بود. تنها يك عصاره قارچي حاوي تركيبات ضد باكتريايي بر عليه باكتري Basiluos sabtilis بود. متابوليت هاي ثانويه فلاون و كينون در اكثر محيط كشت قارچ ها مشاهده گرديد.
Thesis summary
بررسي خواص بيوشيميايي و ضدميكروبي اندوفيت هاي جدا شده از درخت
عاطفه مهجوري 2018
اندوفيت ها ميكروارگانيسم هايي هستند كه درون بافت هاي گياهان بدون ايجاد آسيب ظاهري به گياه زندگي مي كنند. تحقيقات نشان مي دهد كه قارچ هاي اندوفيت منابع بسيار با ارزشي براي توليد تركيبات ضد ميكروبي، توليد متابوليت هاي گوناگون از قبيل متابوليت هاي ثانويه وآنزيم ها جهت استفاده دركشاورزي، صنعت وپزشكي مي باشند. در اين پژوهش نمونه برداري درتابستان و پاييز نودوپنج از درختان سالم سنجد، از چهاربافت مختلف: برگ، ميوه، سرشاخه و تنه شهر همدان صورت گرفت. درمجموع چهل و هفت جدايه قارچي ازبافت هاي مختلف گياه سنجد جداسازي شد. پنج جدايه قارچ اندوفيت با روش هاي مرفولوژيكي ومولكولي (بااستفاده از پرايمر هاي اختصاصي) شناسايي شدند. مقايسه توالي ها در بانك اطلاعات ژني انجام شد.از حلال اتيل استات براي عصاره گيري قارچ هاي اندوفيت استفاده شد وخواص فيتوشيميايي وضد باكتري آن ها بررسي گرديد. نتايج نشان دادكه پنجاه درصد از جدايه هاي قارچي داراي فعاليت آميلازدر محيط و نشاسته آگار بودند، پنجاه درصد داراي آنزيم خارج سلولي پروتئازي، هفت داراي فعاليت سلولازي، نه در صد داراي فعاليت پكتينازي، هفت درصد داراي فعاليت كاتالازبودند وفعاليتآنزيم ليپاز درآزمايشات به اثبات نرسيد. عصاره اتيل استاتي قارچ هاي اندوفيت دو جدايه خاصيت ضد باكتريايي در برابر باكتري هاي بيماري زاي انساني و گياهي داشتند. دربيشتر عصاره هاي قارچ اندوفيت فلاونوئيدها و فلاون ورزين ها حضور داشتند .
Thesis summary
جداسازي و بررسي خواص آنتي اكسيداني و آنتي باكتريايي اندوفيت هاي جدا شده ازگياه گردو
حامد ترك لاداني 2017
اندوفيت ميكروارگانيسم هايي هستند كه بخشي يا تمام چرخه زندگي خود را بدون ايجاد علائم بيماري در داخل گياهان ميزبان سپري مي كنند . اين ميكروارگانيسم ها منبعي غني از آنزيم ها ، تركيبات ضد ميكروبي و متابوليت هاي فعال زيستي هستند. در سال هاي اخير اندوفيت هاي گياهي به دلايل مختلف از جمله تاثير بر رشد گياه و توليد فرآوده هاي مختلف مورد توجه قرار گرفته اند. در اين پژوهش نمونه برداري در پاييز 94 و بهار 95 از درختان سالم گردو، از پنج بافت مختلف؛ گل، برگ، جوانه، پوست و ساقه صورت گرفت. از بافت هاي جمع آوري شده، 90 اندوفيت باكتريايي و 45 قارج جداسازي شدند. آزمايشات بيوشيميايي شامل حضور آنزيم هاي خارج سلولي(آميلاز، ليپاز، پروتئاز، سلولاز و پكتيناز)، تركيبات آنتي اكسيداني ( متابوليت هايي مانند فنل و فلاونوئيد)، فعاليت زيست پالايي (نفت، بنزين، گازوئيل، روغن ترمز، روغن موتور و روغن سوخته) و نيز خاصيت انتي باكتريايي(پاتوژن انساني، حيواني و گياهي) و تاثير عصاره قارچ ها بر روي جوانه زني بذر چند گياه بررسي شد. نتايج نشان داد كه 62 درصد از قارچ ها اندوفيت گردو داراي آنزيم خارج سلولي آميلاز و سلولاز، 22درصد پروتئاز و ليپاز، 55 درصد پكتيناز بودند. 4/64 درصد قارچ ها توانايي رشد در نفت و گازوئيل را داشتند، كه از اين بين 1/31 درصد توانايي تجزيه نفت و 20 درصد توانايي تجزيه گازوئيل را داشتند. 71 درصد از اندوفيت ها در روغن سوخته رشد كردند، اما تنها 44/24 توانايي تجزيه آن را داشتند. 48 درصد از اندوفيت ها توانايي رشد در محيط حاوي يك درصد بنزين را داشتند. عصاره اتيل استاتي قارچ هاي 6A، 13A، 5A، 11A و 18A فعاليت آنتي باكتريايي داشتند. در تمامي عصاره قارچ هاي اندوفيت بررسي شده استروئيد و فلاونوئيد حضور داشت و متابوليت هاي ديگر از جمله كوينون، كومارين، فلاونون، ترپن، فنول و تانن، دي ترپن و آلكالوئيد در برخي از عصاره ها وجود داشت. همچنين شناسايي اوليه سه قارچ 1A، 2A و 13A انجام شد
Thesis summary
جداسازي و شناسايي لاكتوباسيل هاي داراي پتانسيل پروبيوتيكي از لبنيات سنتي شهرستان بوكان و بررسي توانايي آن ها در حذف برخي سموم كشاورزي در شرايط آزمايشگاهي
دلشاد عبداله نيا 2016
چكيده: پروبيوتيك ها ميكروارگانيسم هاي غير بيماري زا و مفيدي هستند كه شناسايي آنها در محصولات لبني سنتي نه تنها مي تواند منجر به جداسازي باكتري هاي پروبيوتيكي با خصوصيات ويژه شود، بلكه مي تواند ديدگاه مناسبي براي توليد انبوه محصولات لبني سنتي كه به طور طبيعي حاوي باكتري هاي پروبيوتيكي هستند، عرضه كند. هدف از اين پژوهش، جداسازي و شناسايي باكتري هاي پروبيوتيك از فلور موجود در محصولات لبني سنتي (ماست، پنير، لورك، سيراج و كشك) شهرستان بوكان مي باشد. از 80 سويه جدا شده، 26 سويه توسط روش هاي فنوتيپي (مورفولوژي، رنگ آميزي گرم، تست هاي بيوشيميايي و فيزيولوژيكي مانند رشد در دماها و غلظت هاي مختلف نمك) شناسايي شدند و پتانسيل پروبيوتيكي آنها (مقاومت به اسيد معده و نمك هاي صفراوي) ارزيابي شد. در بين ايزوله هاي مورد بررسي، ايزوله L12 مقاوم ترين ايزوله به نمك هاي صفراوي با ضريب بازدارندگي نزديك صفر و ايزوله L24 ضعيف ترين ايزوله (ضريب بازدارندگي نزديك يك) از نظر رشد در حضور غلظت 3/0 درصد نمك هاي صفراوي بودند. به منظور تاييد نتايج بيوشيميايي و شناسايي دقيق ايزوله ها، جفت آغازگرهاي اختصاصي، ژن 16s rRNA باكتري هاي لاكتوباسيلوس تكثير داده شده و با استفاده از انزيم هاي اندونوكلئازهاي برشي (روش ARDRA) و مقايسه هاي بيوانفورماتيك تنوع گونه اي باكتري هاي جداسازي شده بررسي گرديد. شش ايزوله متفاوت در الگوي باندي حاصل از هضم آنزيم هاي برشي، تعيين توالي شدند و توالي هاي به دست آمده با داده هاي ثبت شده در NCBI مقايسه شدند. در نهايت، دو ايزوله به عنوان لاكتوباسيلوس پاراكازئي، يك ايزوله لاكتوباسيلوس فرمنتوم، يك ايزوله لاكتوباسيلوس پلانتاروم، يك ايزوله لاكتوباسيلوس كازئي و يك ايزوله به عنوان لاكتوباسيلوس هلوتيكوس شناسايي گرديدند. اثر تيمار باكتري هاي لاكتوباسيلوس بر زنده ماني رده سلولي huvec در حضور سم ديازينون با استفاده از آزمون MTT بررسي گرديد. سويه L12 (لاكتوباسيلوس پلانتاروم) سبب مهار اثر سم شده و درصد زنده ماني سلول هاي huvec را در حضور باكتري تا 40 درصد افزايش داد. در نهايت، تاثير سم بر سلول هاي huvec (آپوپتوز يا نكروز) با استفاده از آزمون قطعه قطعه شدن DNA و رنگ آميزي هسته سلول (DAPI) بررسي گرديد، كه اثر مهاري اين سويه تاييد شد.
Thesis summary
بررسي متابوليت ثانويه و خواص انتي باكتريال دانه گياه اسفرزه بر باكتري هاي بيماري زاي حيواني و گياهي
سليم خسرواني 2016
عصاره گياه اسفرزه با استفاده از حلال هاي مختلف بدست امده و پس از تغليظ خواص انتي باكتريايي ان بر روي تعدادي از باكتري هاي بيماري زاي گياهي و جانوري بررسي گرديد. مطالعات نشان داد كه اين عصاره قادر به ممانعت از رشد باكتري هاي مورد ازمايش بود. همچنين حضور برخي متابوليت ثانويه مانند تركيبات فنلي و فلاونوئيد در اين عصاره تاييد گرديد
بررسي خواص ضد باكتريايي و تركيبات موثره عصاره بره موم، رزين و اندوفيت هاي درخت صنوبر بر رشد باكتري هاي بيماري زا و شناسايي اندوفيت هاي جدا شده
مريم نشوه 2016
بره موم ماده صمغي است كه زنبور عسل با استفاده از رزين جمع آوري شده از جوانه منابع گياهي متنوع و اختلاط با موم، آن را توليد مي كند. زنبور عسل از اين ماده براي بستن سوراخ هاي شانه عسل، صاف كردن ديواره خارجي و حفاظت از دريچه پرواز در برابر مهاجمان استفاده مي-كند. ماده رزيني جدا شده از جوانه هاي صنوبر، بالزام ناميده مي شود كه در محافظت گياه نقش دارد. اندوفيت ها ميكروارگانيسم هايي هستند كه درون بافت هاي گياهان بدون ايجاد آسيب ظاهري به گياه زندگي مي كنند. تحقيقات نشان مي دهد كه قارچ هاي اندوفيت منابع بسيار ارزشمندي براي توليد تركيبات ضد باكتري مي باشند. اهداف اين مطالعه، بررسي تركيبات شيميايي و خاصيت ضد باكتريايي رزين درخت صنوبر، بره موم (توليد شده توسط زنبور عسل) آن و هم چنين جداسازي و شناسايي قارچ هاي اندوفيت درخت صنوبري بودند. در اين پژوهش، بره موم از كندوهاي مستقر در منطقه با پوشش غالب درخت صنوبر گونه Populus deltoides جمع آوري گرديد. براي جمع آوري رزين، جوانه-هاي تازه تشكيل شده صنوبر در بهار جمع آوري شد. از اندام هاي مختلف درخت صنوبر نمونه برداري و قارچ هاي اندوفيت جداسازي گرديد. 30 جدايه قارچ اندوفيت با روش هاي مورفولوژيكي و مولكولي (با استفاده از پرايمرهاي ITS و بتا توبولين) شناسايي و براي اولين بار از روي اين ميزبان گزارش شد. حلال هاي مختلف براي عصاره گيري بره موم، رزين و قارچ هاي اندوفيت استفاده شد و خواص بيوشيميايي و ضد باكتريايي آن ها بررسي گرديد. نتايج نشان داد كه اين عصاره ها (به ويژه عصاره اتيل استات) داراي تركيباتي با خاصيت ضد باكتريايي در برابر باكتري-هاي بيماري زا انساني و گياهي مي باشند و اينكه باكتري هاي بيماري زا گياهي در برابر عصاره ها حساس تر بودند. نتايج آزمون هاي فيتوشيميايي حضور آلكالوئيد ها، استروئيدها، ترپنوئيدها، فلاونوئيدها، فلاون ها، كينون ها، رزين ها و ترپن ها در عصاره هاي مختلف بره موم، بالزام و قارچ هاي اندوفيت را نشان دادند.
Thesis summary
اثر ضد ميكروبي عصاره هاي آبي و الكلي اندام هاي مختلف (برگ، ساقه، گل) و بررسي تنوع ژنتيكي سياه گينه
مصطفي علم هولو 2015
به علت مقاومت به ميكروارگانيسم ها در برابر سموم و انتي بيوتكيك ها استفاده از گياهان دارويي جهت دستيابي به تركيبات جديد و غلبه بر باكتري هاي بيماري زا ضروري بنظر ميرسد. گياه سياه گينه از استان همدان در سال 1392 جمع آوري شده و عصاره هاي مختلف آبي، اتانل و متانولي اندام هاي مختلف آن تهيه شد. تمام عصاره ها بر باكتري هاي بيماري زاي گياهي و انساني اثر ضد باكتري داشتند. تركيبات موثره اين بافت بررسي شده و تركيباتي مانند تيمول، يوگنول و بوتريك اسيد در آنها يافت شدند كه داراي خواص انتي باكتريال هستند. تنوع ژنتيكي جنس هاي اين گياه و دافنه جمع اوري شده از 10 استان ايران به روش ISSR بررسي شد
Thesis summary
اثر ضد باكتري عصاره آبي و الكلي بذور گياهان چشوم، بنه و بلوط ايراني عليه باكتري هاي بيماري زاي گياهي
يوسف امرايي 2014
گياه چشوم چمع آوري و عصاره آبي و الكي بافت هاي مختلف آن تهيه شد. اثر ضد باكتريايي اين عصاره ها بر عليه باكتري هاي بيماري زاي گياهي بررسي شد. اين مطالعات نشان داد كه اين گياه مي تواند از رشد ميكروارگانيزم هاي گياهي جلوگيري كند
اثر ضد ميكروبي، آنتي اكسيداني عصاره اندام هاي مختلف و شناسايي فيتوشيميايي برخي متابوليت هاي ثانويه بالنگ Citrus medica و پومولو Citrus grandis
محدثه شجاعي مهر 2014
متابوليت هاي ثانويه در محيط كشت كالوس و ريشه مويين گياه بنگدانه
رسول نجيبي كتايونچه 2013